实验室全自动洗瓶机多为箱式，分别为单端式和双端式全自动洗瓶机。单端式洗瓶机脏瓶的进入和净瓶的输出都在洗瓶机的同一侧，也叫来回式洗瓶机；双端式洗瓶机，瓶子是由一端进去从另一端出来，也叫直通式洗瓶机。

　　2种进出瓶方式的洗瓶机各有特点：单端式的脏瓶与净瓶距离较近，容易造成净瓶的污染，影响洗瓶质量；双端式的瓶套自出瓶处回到进瓶处为空载，洗瓶空间的利用不如单端式。

　　在实验室全自动洗瓶机内，瓶子是套在输瓶链带上的瓶套里完成洗瓶的。按输瓶链带的运动方式，全自动洗瓶机可以又分为间歇式和连续式2类：

　　①间歇式洗瓶机在进瓶时，输瓶链带及瓶套有一个短时间的停留，用喷头冲洗瓶子时，瓶子也是静止的，这种洗瓶机结构简单，动作准确，但是由于瓶套的负荷重，运动时的冲击较大；

　　②连续式洗瓶机输瓶链带一般设计成匀速连续运动，这样所需的驱动力低，同时能够避免间歇运动造成的瓶子在瓶罩内的来回碰撞，而减少瓶子母线的磨损及瓶子破裂，其结构较为复杂。